Nesta linha de pesquisa busca-se integrar diversos modelos simplificados capazes de simular os diversos componentes existentes em sistemas energéticos de embarcações para então aplicar um algoritmo de otimização. Este algoritmo tem a função de buscar a melhor configuração do sistema (síntese), a melhor configuração de cada componente do sistema (projeto) e a melhor configuração operacional (operação) do sistema. Assuntos como índices de eficiência energética (EEDI, EEXI…) e outras medidas para a redução da emissão de gases pelo transporte marítimo também são assuntos de interesse desta linha de pesquisa. Nesta linha de pesquisa são aplicados preferencialmente softwares de código aberto ou gratuitos.